10月2日，省政协副主席、广东省卫生厅厅长姚志彬、副厅长黄飞等带领厅相关处室人员和疾控专家深入茂名市高州、信宜和阳江市阳春等重灾区，指导灾区卫生系统灾后重建和救灾防病工作，慰问战斗在一线的医务工作者。姚志彬厅长要求省救灾复产卫生工作小组、省派驻灾区的医疗卫生防疫专家组继续深入灾区一线，全力做好饮用水源、食品卫生监管，环境消杀、疾病监测防控、病人救治等方面的工作，确保各项工作落实到位，保障灾区人民群众的身体健康。
    台风“凡亚比”给灾区的卫生系统造成严重损失，多间卫生院、卫生站和预防接种规范门诊房屋倒塌，大批医疗药械和冷链设备等遭受损失，灾区传染病网络直报系统和计划免疫冷链系统遭到严重破坏。为恢复灾区疾病预防控制能力，确保传染病网络直报和计划免疫冷链系统正常运转，10月1日，省卫生厅派出流行病学、计划免疫和网络信息等方面的专家，赶赴阳江、茂名市等灾区，深入受灾一线，现场指导设备安装调试、组织人员培训。到10月2日下午，省卫生厅和省疾病预防控制中心紧急调拨的一批专用于疫情报告和冷链系统运转的物资，包括10台电脑、10台传真机、10台打印机、10台冷链冰箱、20个冷链包等已全部到位，灾区传染病疫情网络直报系统和计划免疫冷链系统已全面恢复。
    目前，灾区医疗卫生防疫工作有序开展，未发现传染病流行及食物中毒事件。